一、中风门二、风痹门三、心腹痛门四、霍乱门五、呕吐门六、气门七、痰饮门八、痨瘵门九、胁痛门十、腰痛门十一、香港脚门十二、积聚门十三、脾胃门十四、补益门（一）导引行气法（二）虾蟆行气法（三）入火法（四）
萧序范序朱序何序卷一医工论禀受论初生论回气论洗浴论断脐论相视寿夭论初生服药论中寒论初生不乳论脐风撮口论胎中病论诸不治病卷二五气论心肝脾肺肾乳母论慎护论食忌论大小论诸般色泽纹证论诸色泽候诸处纹状候五脏主
风劳臌膈四大证治
简介自序东洞先生著述书日记卷上卷中卷下跋《药征续编》序卷上卷下《药征续编》附录《药征续编》附言十七则
简介序凡例卷上卷中卷下
金疮赋按脉论行拳法分轻重论打人论总论秘授跌打损伤要诀金枪论接骨诸方金枪不治症又接骨议论方
正文附经目屡验良方
赵序吴序卷一阴阳脏腑亢害承制卷二望色切脉辨证施治卷三二十六字符机理固润涩通塞清扬逆从求责缓峻探兼候夺寒热补泻提越应验卷四用药权衡炮制心法卷五古经解卷五古方解十全大补汤·八珍汤归脾汤补中益气汤四君子汤四
自叙凡例白喉证论辩证法辨脉法用药法白喉热证尚轻治法白喉热证渐重治法白喉寒证尚轻治法白喉寒证渐重治法白喉虚热证治法白喉虚寒证治法白喉寒热错杂证治法续方白喉误治坏证治法白喉愈后补虚治法妇人白喉证小儿白喉证
序原序卷一调经上月经先期月经后期月经或前或后月经愆期过期经行形瘦经不调形瘦过期经行形肥过期经行一月经再行每月经来二三次经来不止数月行经经来色紫经来色淡形瘦经少形肥经少经来过多经来如猪肝水经来如屋漏水经