序卷之一温邪门暑邪门伏暑门疟疾门痢疾门黄胆门卷之二中风门肝风痰火门虚劳门吐血门臌胀水肿门卷之三积聚门（附虫积）脘腹痛门噎膈反胃门三消门痰饮门痰喘门卷之四咳嗽门疝气门遗精淋浊门痉厥门杂病门妇人门产后门幼
卷第一治伤寒时气、温疫初起方治疫气伤寒，三日以后不解者方治伤寒中风方治伤寒汗出不解如疟方治伤寒胸闷、腹满方治伤寒后呕恶不食虚羸方治伤寒后烦渴及口干方治伤寒后下利脓血及发斑方治伤寒鼻衄、喉痛、疮方治伤寒
《本草衍义》提要序卷一序例上衍义总叙卷二序例中卷三序例下内容卷四玉泉丹砂空青绿青云母石钟乳朴硝芒硝硝石英硝矾石滑石紫石英白石英赤石脂白石脂石中黄子婆娑石无名异菩萨石卷五金屑银屑水银水银粉雄黄雌黄石硫黄
《评琴书屋医略》提要自叙凡例序附诗并各题赠卷一外感症春日外感夏日外感秋日外感冬日外感春温症(冬温同论症治)暑症附案(暑邪变疟)湿症泄泻症痢症附论时行传染二症疟症附案(暑邪变疟)又案(疟后辨寒热)卷二消
卷一卷二卷三卷四补编徐何辨症李中梓姚蒙与袁绮香谭医古西医电气治病听肺木戒烟良方圣治丸方论
卷之一周身经穴赋十二经脉歌十二经本一脉歌经穴起止歌十五脉络歌经脉气血多少歌禁针穴歌禁灸穴歌血忌歌逐日人神歌九宫尻神歌太乙人神歌孙思邈先生针十三鬼穴歌长桑君天星秘诀歌马丹阳天星十二穴并治杂病歌四总穴歌千
劝读十则
序叙论痈疽发背第一服药通变方第二荣卫返魂汤用敷贴温药第三冲和仙膏敷贴热药第四回阳玉龙膏敷贴凉药第五洪宝丹合用诸方第六黄矾丸柞木饮子三石散栝蒌散真君妙贴散追风丸搜损寻痛丸复煎散神锋散乌金散索血散葛根汤散
序上籍食治养老益气方第一食治老人眼目方第二食治老人耳聋耳鸣诸方第三食治老人五劳七伤诸方第四食治老人虚损羸瘦诸方第五食治老人脾胃气弱方第六食治老人泻痢诸方第七食治老人烦渴热诸方第八食治老人水气诸方第九食
原序本草从新凡例药性总义卷一草部山草类人参珠儿参党参土人参西洋人参北沙参空沙参甘草黄精萎蕤黄野白术种白术苍术桔梗天麻秦艽柴胡前胡独活羌活防风升麻细辛远志金毛狗脊淫羊藿巴戟天琐阳肉苁蓉白芨三七地榆丹参元