叙例言上卷人身阴阳五脏所生五脏所属五脏所藏五脏所主脏腑所合脏腑之官五藏九窍男女天癸血气所生营卫生会六经六气经气主治十二经脉冲任督带下卷全体总论五脏所伤五脏所恶脏腑为病诸病所属四时所病脏腑通治望形察色闻
原序一原序二原序三自序医道积习通弊论辨治温热病中宜用白虎汤并不伤人以解世俗之惑，并明概投附、桂、干姜杀人之误卷一·礼集草部甘草生地黄熟地黄麦门冬天门冬葳蕤玄参沙参贝母知母天花粉百部款冬花紫菀郁金桔梗茅
自序卷上绪论章第一六法兼施章第二脉诀章第三处方章第四家庭医案章第五卷下悬壶医案章第六药性裁成章第七方诀无隐章第八三子养亲汤霞天膏鹿丸斑龙宴内鹿髓丸外鹿髓丸黄鹤丹青囊丸天一丸异类有情丸女金丹驻阳小丹炼法
灵枢经
卷第一孔志约序梁·陶隐居序合药分剂料理法卷第二诸病通用药疗风通用风眩头面风中风脚弱久风湿痹贼风挛痛暴风瘙痒伤寒大热劳复温疟中恶霍乱转筋呕大腹水肿肠下痢大便不通小便淋小便利溺血消渴黄胆上气咳嗽呕吐痰饮宿
铜人针灸经点校说明卷一卷二卷三卷四卷五卷六卷七
濒湖炮炙法
伤寒心境别集
自叙凡例卷一总论察色听声脉法脉应杂病看虎口三关法小儿指形图（十五幅）（图缺）初生诸病胎惊胎痫胎风胎黄胎寒胎热撮口鹅口（一名噤口风．又名雪口．）脐风脐湿肿脐疮脐突惊风惊搐由脏腑惊搐痫痉不同伤风伤食发搐惊
颅顖经